Эберсон окончил школу в Дрездене, Саксония. В 1896 г. окончил Венский университет, получив диплом инженера-электрика, и вступил в 14-й гусарский полк Австрийской армии. В 1901 г. иммигрировал в Соединённые Штаты, поселился в Сент-Луисе, Миссури. В течение нескольких лет работал в местной электрической компании, затем начал сотрудничать с компанией Johnson Realty and Construction, занимавшейся проектированием и строительством кинотеатров и оперных театров.

В 1901 г. Эберсон перебрался в Гамильтон, Огайо. Именно здесь был построен его первый кинотеатр Hamilton Jewel на 350 мест. Переехав в 1910 г. в Чикаго, он начал получать многочисленные заказы на всё новые кинотеатры в разных городах страны. С 1921 г. он предпочитал строить в т.н. "атмосферическом" стиле, при котором кинотеатр выглядел как дворец, а его посещение превращалось в праздник.

В 1926 г. Эберсон открыл офис в Нью-Йорке и начал активно сотрудничать с компанией Маркуса Лоу, которая осуществила самые известные его проекты. Всего он спроектировал более 100 "кинодворцов", используя различные архитектурные стили - неомавританский, ар-деко, стримлайн-модерн, итальянский Ренессанс и др. Они располагались в десятках штатов Америки, а также в Мехико (Мексика) и в Перте, Сиднее и Мельбурне (Австралия).

Архитектурное бюро Эберсона разрабатывало и другие проекты - жилые здания, больницы, спортзалы, рестораны - всего около 500 зданий, большая часть которых к 21-му веку не сохранилась. Его сын Дрю Эберсон был партнёром, а затем продолжателем дела отца.

Имя Джон - английская форма библейского имени Йехоханан, означающего "Яхве милостив". Имя Адольф - от древненемецких слов adal - "благородный" и wolf - "волк". Имя Эмиль происходит от латинского слова aemulus - "не уступающий". Происхождение фамилии Эберсон не установлено.