Семья Хеллера вскоре после Кишинёвского погрома 1903 года пперебралась в Южную Филадельфию. Бернард получил степень бакалавра искусств в Пенсильванском университете в 1916 году, степень магистра - в Колумбийском университете в 1917 году, был посвящён в раввины в Хибру-Юнион-колледже в Цинциннати в 1920 году. С 1920 по 1930 год р. Хеллер служил в Скрэнтоне, штат Пенсильвания, и стал широко известен своей религиозной и общественной деятельностью. Затем он служил в Фонде "Бнай-Брит Гиллель" в Мичиганском университете, где ему в 1932 году была присуждена степень доктора философии. Он также был награждён почетной докторской. степенью Еврейской теологической семинарии Америки.

В 1943 г. Хеллер был назначен в комиссию, созданную для устранения предвзятых упоминаний евреев в католических и протестантских учебниках. В 1949 г. он был назначен директором Restitution of Jewish Cultural Reconstructio - агентства, занимающегося восстановлением культурных ценностей, захваченных нацистами у еврейского народа. Из штаб-квартиры во Франкфурте-на-Майне Хеллер занимался распределением более 30 тысяч конфискованных томов, многие из которых были редкими и ценными.

В начале 1950-х годов Хеллер отправился в Индию, где он служил раввином либеральной общины Бомбея, а затем в Австралию и другие части мира, где он читал лекции на еврейские темы и основывал еврейские исследовательские группы. С 1952 года до выхода на пенсию он преподавал еврейскую этику и религию в Хибру-Юнион-колледже.

Хеллер опубликовал множество статей и ряд книг. Его "Послание к отступнику" (1951) было ответом на попытки принизить иудаизм. В книге "Рассвет или закат" (1961) Хеллер показал, как антисемитские идеи средневековой Европы подготовили почву для нацизма. Однако его самая известная работа - "Одиссея веры" (1942).

После многих лет раввинской службы д-р Хеллер стал активо заниматься бизнесом в качестве одного из основателей компании оптовой торговли United Brands Corporation, а также Вест-Индской инвестиционной компании на Виргинских островах США. Он учредил Фонд доктора Бернарда Хеллера в интересах еврейского образования и благополучия еврейского народа в Израиле. Его именем назван музей Еврейского института религии в Нью-Йорке.

Имя Бернард - германского происхождения, от слов Bern  - "медведь" и hard - "смелый, сильный".  Фамилия Геллер образована от названия немецкого города Швебиш-Халль (земля Баден-Вюртемберг).