Раннее детство Джонатана прошло в Японии и Южной Корее, где служил его отец. Джонатан окончил лучшую нью-йоркскую городскую школу "Стайвесант" (1985), затем получил степень бакалавра искусств по английской литературе в Уэслианском университете (1989) и степень доктора права в Школе права Нью-Йоркского университета (1997). В  1997 - 2011 гг. Фрид работал советником по судебным спорам в адвокатской фирме Kramer Levin Naftalis & Frankel LLP. С мая 2011 г. - главный юрисконсульт компании социальных услуг Ryan Health. В 1996 г. она женился на Шэрон Гринбергер, они живут в Бруклине, у них две дочери. Они прихожане Конгрегации Бет Элохим в р-не Парк-Слоуп, в 2014-17 гг. Фрид был президентом Конгрегации.
 

Имя Джонатан - английская форма библейского имени Yehonatan, означающего "Яхве дал". Фамилия Фрид в переводе с немецкого означает "мир".